大便的时候肛门有点疼，可能是以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.外痔：肛门缘皮肤皱襞突起，皮下有淤血、水肿，伴有疼痛，排便时疼痛加重，并有少量出血。
3.内痔：通常无疼痛，但发生内痔嵌顿、感染时，会出现肛门疼痛。
4.肛周脓肿：是直肠肛管周围软组织内或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，主要表现为肛周持续性剧痛，还可能伴有寒战、发热、乏力等全身症状。
5.肛管直肠损伤：多为外物或异物损伤肛管直肠所致，裂口较小，可自愈。
6.肛门直肠神经官能症：阴部神经症候群，因肛管部位神经与骶尾神经分布在会阴部及腰骶部皮肤，所以肛门痛常伴有会阴部及腰骶部疼痛。
此外，其他肛肠疾病，如肛管炎、肛窦炎等，也可能导致大便时肛门疼痛。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如出血、肿块等，建议及时就医，明确诊断，并进行相应的治疗。同时，保持良好的饮食习惯和排便习惯，有助于预防肛肠疾病的发生。