大便出血肛门疼痛可能由多种原因引起，常见的有以下几种：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵裂后形成的小溃疡，通常会引起肛门疼痛和便血。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛门检查时可发现肛裂的裂口。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，可导致肛门括约肌痉挛，进而引起疼痛。此外，内痔或混合痔可因反复便血导致贫血，也会出现面色苍白、乏力等症状。肛门检查有助于明确诊断。
3.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，可引起肛门疼痛和便血。中老年人、有肛肠疾病家族史、长期吸烟饮酒、高脂肪低纤维饮食者，是肛管或直肠肿瘤的高危人群。直肠指诊、结肠镜检查等有助于早期发现肿瘤。
4.溃疡性结肠炎：一种病因尚不明确的直肠和结肠慢性非特异性炎症性疾病，主要表现为腹泻、黏液脓血便、腹痛等。病情轻重不等，多呈反复发作的慢性病程。结肠镜和（或）黏膜活检有助于诊断。
5.缺血性肠病：因肠系膜动脉栓塞或血栓形成，导致肠壁缺血、坏死，从而引起腹痛、便血。多见于有房颤、动脉硬化等心脑血管疾病的老年人。腹部血管造影有助于诊断。
6.其他：肛门周围脓肿、肛瘘、直肠息肉等也可引起大便出血和肛门疼痛。此外，某些全身性疾病，如白血病、血小板减少性紫癜等，也可导致此类症状。
总之，大便出血肛门疼痛的原因较为复杂，可能是良性疾病，也可能是恶性疾病。出现此类症状应及时就医，进行相关检查，如肛门指诊、结肠镜等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。