大便出血肛门疼痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。
2.痔疮：内痔或混合痔发展到一定程度即能脱出肛门外，内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，则出现肛门疼痛。
3.肛管或直肠肿瘤：肛管、直肠肿瘤溃烂发生感染时，可有脓血、黏液从肛门排出，伴有肛门部疼痛。
4.直肠、结肠炎症：炎症性肠病累及直肠和结肠时，肛门疼痛为主要症状之一，同时可伴有腹泻、黏液脓血便等表现。
5.肛门损伤：如肛裂、侧切等手术或外伤后，可因肛门括约肌痉挛出现疼痛。
6.其他：如肛窦炎、肛瘘、肛门脓肿等，也可出现肛门疼痛、便血等症状。
总之，引起大便出血肛门疼痛的原因较多，且可能是严重疾病的表现，因此出现该症状时应及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。