引起下蹲和起身时膝盖疼的原因有很多，常见的有以下几种：
1.运动损伤：如果近期有进行过剧烈的运动或体力劳动，可能会导致膝盖的半月板、韧带等结构受损，从而引起疼痛。
2.骨关节炎：骨关节炎是一种常见的退行性疾病，多见于老年人。其主要症状为关节疼痛、僵硬、肿胀等，下蹲和起身时膝盖疼可能是其表现之一。
3.髌骨软化症：髌骨软化症主要是由于髌骨软骨的损伤和退变引起的。其主要症状为髌骨下方疼痛，下蹲和起身时疼痛加重。
4.半月板损伤：半月板是位于膝关节内部的软骨结构，具有缓冲和稳定膝关节的作用。半月板损伤后，可能会出现膝关节疼痛、肿胀、弹响等症状，下蹲和起身时疼痛也会加重。
5.滑膜皱襞综合征：滑膜皱襞是膝关节滑膜的一部分，当其发生炎症或损伤时，可能会引起膝关节疼痛、肿胀、活动受限等症状。
6.其他：除了上述原因外，膝关节感染、肿瘤、风湿性疾病等也可能导致下蹲和起身时膝盖疼。
如果出现下蹲和起身时膝盖疼的症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，应注意保护膝关节，避免过度劳累和受伤，保持适当的运动和体重，以预防膝关节疾病的发生。