肛门里面隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.痔疮：内痔或混合痔通常无明显疼痛，当内痔或混合痔发生血栓形成或嵌顿时则会引起肛门疼痛。
2.肛裂：典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛门检查时可发现肛裂的裂口。
3.肛管炎：肛管黏膜的急慢性炎症也可引起肛门疼痛，多伴有肛门下坠感、排便不尽感。
4.肛窦炎：通常表现为肛门内隐痛、坠胀，排便时加重。
5.肛周脓肿：肛门周围出现红肿、疼痛的肿块，可能伴有发热、寒战等全身症状。
6.直肠肛管损伤：如肛门裂伤、肛管直肠手术等，可引起肛门疼痛。
7.肛门直肠神经官能症：患者可自觉肛门疼痛，但其肛门局部并无明显器质性病变。
如果出现肛门里面隐隐作痛，建议及时就医，进行详细的肛门指诊、肛门镜或结肠镜等检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。在等待就医期间，应注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，避免久坐、久蹲等。