大便肛门疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘导致，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，可发生水肿、感染、坏死，导致肛门疼痛。
3.肛管或直肠损伤：肛管或直肠因外伤或手术而导致的裂伤，可引起肛门疼痛。
4.肛门直肠周围脓肿：肛门周围间隙发生急慢性感染而形成脓肿，常见症状为肛周持续性跳动性疼痛。
5.肛窦炎：肛窦炎是引起肛门部下坠感的主要原因，表现为肛门疼痛、灼热，排便时加重。
6.直肠癌：肛管直肠癌侵犯肛门部，可导致肛门疼痛。
7.其他：肛门周围皮肤感染、溃疡性结肠炎、克隆恩病等也可能引起肛门疼痛。
如果出现大便肛门疼的症状，建议及时就医，明确原因，并进行相应的治疗。同时，保持良好的饮食习惯和排便习惯，预防便秘，有助于减少肛门疼痛的发生。