大便肛门疼可能由肛裂、外痔、内痔、肛管或直肠的炎症性疾病、肿瘤、感染性疾病、外伤、神经官能症等多种原因引起，需要及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。
大便肛门疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
一、肛裂
1.肛管皮肤全层纵裂后形成的小溃疡，方向与肛管纵轴平行，呈梭形或椭圆形，常引起肛周剧痛。
2.好发于肛管后正中线上，也可在前正中线上，或其他部位。
3.典型症状是疼痛、便秘和出血。
二、外痔
1.位于肛管齿状线以下，由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。
2.外痔表面盖以皮肤，可以看见，不能送入肛内，不易出血，以疼痛和有异物感为主要症状。
3.临床常分为结缔组织外痔、静脉曲张性外痔、炎性外痔和血栓外痔。
三、内痔
1.内痔是肛垫的支持结构、血管丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位。
2.内痔位于齿状线以上，表面覆盖黏膜，常因粪便干结而导致排便时滴血或喷射状出血。
3.内痔逐渐增大，排便时可脱出肛外，若发生嵌顿，可致肿痛、糜烂、坏死，甚至化脓、感染。
四、其他
1.肛管或直肠的炎症性疾病，如克罗恩病、溃疡性结肠炎等，也可引起肛门疼痛。
2.肛管或直肠的肿瘤，如直肠癌、肛管癌等，可导致肛门疼痛、出血、肿块等症状。
3.肛门周围的脓肿、肛瘘等感染性疾病，可引起肛门局部红肿、疼痛、流脓等症状。
4.肛门部的外伤，如肛裂、肛管或直肠的手术等，可导致肛门疼痛和出血。
5.肛管或直肠的神经官能症，也可引起肛门疼痛，但多无明显的器质性病变。
总之，大便肛门疼可能是一种症状，也可能是多种疾病的表现。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。