三个月宝宝咳嗽喉咙有痰，可采取以下方法：
1.补充水分：多喝水能湿润呼吸道，稀释痰液，缓解咳嗽。
2.拍背排痰：让宝宝侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。每侧拍3~5分钟，每天拍2~3次。
3.蒸汽止咳：将开水倒入杯中，抱起宝宝，使其口鼻对着蒸汽，随着呼吸将蒸汽吸入气管、支气管内，痰液经稀释后就容易被咳出。但要注意防止烫伤宝宝。
4.药物治疗：在医生的指导下，给宝宝服用止咳化痰的药物。
如果宝宝咳嗽、喉咙有痰的症状持续时间较长或加重，应及时就医，以免延误病情。