早上起来小腹痛，可能是以下原因引起：
1.生理性因素：
憋尿：膀胱内尿液充盈，可导致晨起时小腹痛。
夜间腹部受凉：腹部受凉可引起胃肠道痉挛，导致腹痛。
2.病理性因素：
肠道疾病：如肠炎、肠痉挛、肠梗阻等，可导致腹痛。
泌尿系统疾病：如膀胱炎、尿道炎、前列腺炎等，可引起小腹疼痛。
妇科疾病：如盆腔炎、宫颈炎、子宫内膜异位症等，也可导致晨起小腹疼痛。
其他：如腹部肌肉拉伤、腹部手术后等，也可能引起腹痛。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐、腹泻、尿频、尿急、尿痛等，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。