宝宝突然发烧39度但无其他症状，可能由以下原因引起：
1.幼儿急疹：多见于6-18个月的宝宝，体温可突然升高至39-40℃，一般情况良好，高热时可有惊厥，耳后枕部淋巴结亦可肿大，常伴有轻度腹泻。高热3-5天后，体温骤降，同时或稍后出疹，皮疹为红色斑丘疹，散布在躯干、颈部及上肢，皮疹1-2天消退，若无并发症，一般情况良好。
2.上呼吸道感染：宝宝年龄较小，鼻腔短小、鼻道狭窄、鼻黏膜柔嫩，血管丰富，容易发生炎症，炎症使宝宝鼻塞，鼻黏膜充血肿胀，分泌物增多，导致吃奶时因鼻塞而影响呼吸，出现吃奶差或不吃奶，甚至呛奶。
3.急性扁桃体炎：宝宝受凉、潮湿、过度疲劳、烟酒过度、有害气体刺激等因素容易导致急性扁桃体炎，宝宝会出现高热、寒战、咽喉疼痛、吞咽困难等症状。
4.川崎病：是一种以全身性血管炎为主要病变的急性发热出疹性小儿疾病，高发年龄为5岁以下婴幼儿，男多于女，成人及3个月以下小儿少见。临床多表现为发热，体温常达39℃以上，抗生素治疗无效，发热5天以上，伴下列5项中的4项者，排除其他疾病后即可诊断为川崎病：①四肢变化：掌跖红斑，手足硬性水肿；恢复期蜕皮；②多形性红斑；③眼结合膜充血，非化脓性；④唇充血、干裂，口腔黏膜充血，草莓舌；⑤颈部淋巴结肿大。
5.其他：疫苗接种后、夏季低热、药物热、脱水热等也可导致宝宝突然发烧39度，但无其他症状。
如果宝宝突然发烧39度但无其他症状，建议及时就医，明确原因，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意给宝宝多喝水，保持室内空气流通，饮食清淡，注意休息。