月经结束三天后进行性行为一般不会怀孕，但也不是绝对的，需要根据个人的月经周期和排卵情况来判断。以下是关于这个问题的一些具体分析：
1.女性的排卵日期一般在下次月经来潮前的14天左右。卵子自卵巢排出后在输卵管内能生存1～2天，以等待受精；男子的精子在女子的生殖道内可维持2～3天受精能力，故在卵子排出的前后几天里性交容易受孕。如果月经周期规律，月经结束三天时通常还没有排卵，怀孕的可能性较小。
2.但需要注意的是，女性的排卵时间可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而发生改变，有时可能会提前或推迟。此外，精子在女性体内可能会存活数天，等待卵子受精。因此，即使月经结束三天时怀孕的几率较低，也不能完全排除怀孕的可能。
3.如果不希望怀孕，建议在任何性行为中都采取适当的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。这些措施可以有效地降低怀孕的风险，并预防性传播疾病的传播。
4.对于月经周期不规律或存在其他生育问题的女性，建议咨询医生或专业的医疗机构，进行详细的身体检查和咨询，以了解自己的生育状况和避孕需求。
总之，虽然月经结束三天后怀孕的几率较低，但不能完全排除怀孕的可能。在进行性行为时，建议采取适当的避孕措施，以保护自己的身体健康。如果对怀孕或避孕有任何疑问或担忧，应及时咨询专业医生的建议。