怀孕40天孕囊大小约为5mm左右，但具体孕囊大小因人而异。
怀孕40天时，孕囊刚刚形成，还很小。通过B超检查，可以在子宫内看到一个圆形或椭圆形的孕囊结构，但其具体大小会因个体差异、受孕时间等因素而有所不同。一般来说，孕囊的平均直径在5mm左右，但有些孕囊可能稍大一些，而有些则可能稍小一些。
需要注意的是，孕囊大小只是评估怀孕情况的一个指标之一，还需要结合其他因素来综合判断，如胎芽、胎心搏动等。此外，医生还会关注孕囊的位置是否正常，以排除宫外孕的可能。
如果孕囊大小与孕周不符，或者出现其他异常情况，医生可能会建议进一步检查或采取相应的措施。因此，在怀孕期间，孕妇应按照医生的建议进行定期产检，以确保胎儿的健康发育。