三个月的宝宝喉咙有痰，可能是生理原因，也可能是疾病导致。以下是一些建议：
1.保持空气湿润：可以使用加湿器增加空气湿度，有助于稀释痰液，使宝宝呼吸更顺畅。
2.拍背排痰：让宝宝侧卧，家长五指稍屈，握成空手拳，轻轻地拍打宝宝前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，从下往上，从外向内，依次进行。拍背能促使宝宝肺部和支气管内的痰液松动，向大气管引流并排出，从而改善肺部的血液循环，减少痰液在呼吸道内的潴留，使呼吸道通畅。
3.多喂水：多喝水可以使痰液稀释，缓解喉咙有痰的症状。
4.及时就医：如果宝宝喉咙有痰的同时，还伴有咳嗽、呼吸急促、发热等症状，可能是感染引起的，需要及时就医，在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，不要随意给宝宝使用止咳药，因为咳嗽是一种自我保护机制，可以帮助清除呼吸道内的痰液和异物。如果宝宝咳嗽不严重，没有影响到睡眠和进食，一般不需要使用止咳药。