三个月宝宝喉咙有痰，可能是正常的生理现象，也可能是疾病引起的。以下是一些建议：
1.观察宝宝的情况：如果宝宝精神状态良好，吃奶、睡眠正常，没有咳嗽、气喘等症状，可以先观察一段时间，看看痰是否会自行消失。
2.保持室内空气湿润：可以使用加湿器增加室内空气湿度，有助于缓解喉咙的不适。
3.拍背排痰：让宝宝侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。每侧拍3~5分钟，每天拍2~3次。
4.多喂水：可以帮助稀释痰液，促进痰液咳出。
5.就医：如果宝宝喉咙有痰的症状持续时间较长，或者出现了咳嗽、气喘、发热等症状，可能是患有呼吸道感染等疾病，需要及时就医。医生会根据宝宝的具体情况进行诊断和治疗，可能会使用药物化痰、止咳、平喘等。
需要注意的是，三个月的宝宝还比较小，身体各器官尚未发育成熟，对于药物的耐受性和反应性也与成人不同。因此，在给宝宝使用任何药物之前，都应该先咨询医生的意见，按照医生的建议使用药物。同时，在给宝宝治疗疾病的过程中，家长也应该密切观察宝宝的病情变化，如有异常应及时就医。