跑步后膝盖外侧疼痛的原因主要有以下三种：
1.髂胫束综合征：
跑步时，髂胫束与股骨外髁反复摩擦，可能导致髂胫束损伤，从而引起膝盖外侧疼痛。
这种疼痛通常在跑步或其他运动后加重，休息时可能会有所缓解。
治疗方法包括物理治疗、药物治疗（如非甾体抗炎药）和注射治疗等。
2.外侧半月板损伤：
外侧半月板是膝关节的重要结构之一，跑步时半月板受到挤压和旋转，容易发生损伤。
半月板损伤可能导致膝盖外侧疼痛、肿胀、弹响等症状。
磁共振成像（MRI）检查有助于诊断半月板损伤，治疗方法根据损伤程度而定，可能包括保守治疗或手术治疗。
3.髌骨外侧高压综合征：
髌骨外侧高压综合征是指髌骨外侧压力过高，导致髌股关节疼痛和不适。
这种情况可能与跑步时的姿势、肌肉力量不平衡等因素有关。
治疗方法包括物理治疗、药物治疗、注射治疗和手术治疗等，具体治疗方案应根据个体情况制定。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，其他因素如韧带损伤、滑膜炎等也可能导致膝盖外侧疼痛。如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便制定合适的治疗方案。同时，跑步前要做好热身运动，选择合适的跑鞋，控制跑步强度和时间，避免过度劳累。