一、肠道疾病相关原因
（一）炎症性肠病
1.克罗恩病：是一种慢性炎性肉芽肿性疾病，多见于末段回肠和邻近结肠，但从口腔至肛门各段消化道均可受累，呈节段性或跳跃式分布。患者可出现长期解大便不成形，还可能伴有腹痛、体重下降等症状。其发病机制可能与遗传、免疫等因素有关，遗传因素在克罗恩病的发病中起到一定作用，有家族聚集现象；免疫因素则是由于肠道免疫调节失衡，导致肠道炎症持续存在。不同年龄均可发病，青壮年较为多见。
2.溃疡性结肠炎：主要累及直肠和结肠，病变多呈连续性、弥漫性分布。临床表现为腹泻、黏液脓血便、腹痛等，也会出现长期大便不成形的情况。发病与环境、遗传、免疫等因素相关，环境因素可能包括饮食、吸烟等，遗传易感性使得个体更容易发生肠道免疫异常，从而引发炎症。各年龄段均可发病，以20-40岁多见。
（二）肠易激综合征
这是一种常见的功能性胃肠病，病因尚不明确，可能与胃肠动力异常、内脏高敏感性、肠道感染后、精神心理因素等有关。患者以腹痛、腹胀或腹部不适伴排便习惯改变为特征，可表现为长期解大便不成形，排便频率可增加或减少，部分患者腹泻与便秘交替出现。各个年龄阶段均可发病，中青年多见，女性略多于男性。精神紧张、焦虑等情绪因素可诱发或加重症状。
（三）感染性肠炎
1.细菌感染：如大肠杆菌、沙门氏菌等感染肠道后，可引起肠道炎症，导致肠道黏膜受损，影响肠道的正常吸收和分泌功能，从而出现大便不成形。患者多有不洁饮食史，可伴有腹痛、发热等症状。不同年龄均可发生，儿童由于卫生习惯相对较差，更容易发生细菌感染性肠炎。
2.病毒感染：轮状病毒、诺如病毒等感染肠道后，也会引起肠道炎症，导致大便不成形。轮状病毒感染多见于婴幼儿，诺如病毒感染则可发生在各个年龄阶段，常在学校、幼儿园等集体场所引起暴发流行。
二、消化不良相关原因
（一）慢性胰腺炎
胰腺分泌的胰酶是消化食物的重要酶类，慢性胰腺炎时，胰腺外分泌功能受损，胰酶分泌不足，影响食物的消化和吸收，导致大便不成形，常为脂肪泻，大便量多、有油光、恶臭。发病与长期酗酒、胆道疾病等因素有关，长期酗酒可损伤胰腺组织，胆道疾病如胆结石可引起胰管梗阻，影响胰液排出，从而引发慢性胰腺炎。各年龄均可发病，长期酗酒者更易患病，男性多于女性。
（二）肝胆疾病
1.慢性肝炎：肝脏是重要的消化器官，慢性肝炎时，肝脏功能受损，胆汁分泌和排泄异常，影响脂肪的消化和吸收，可导致大便不成形。患者还可能伴有乏力、黄疸、食欲不振等症状。不同年龄均可发病，由病毒性肝炎引起的慢性肝炎在各年龄段均有，药物性肝炎等则与用药情况相关，有特定的好发人群。
2.胆囊炎：胆囊炎可影响胆汁的储存和排放，胆汁对脂肪的消化至关重要，胆囊炎发作时，胆汁排出不畅，会导致脂肪消化吸收障碍，出现大便不成形，常伴有右上腹疼痛、恶心等症状。各个年龄均可发病，女性发病率相对较高，尤其是肥胖、多次妊娠的女性。
三、全身性疾病相关原因
（一）甲状腺功能亢进症
甲状腺激素可促进机体的新陈代谢，甲状腺功能亢进时，机体代谢亢进，胃肠蠕动加快，患者可出现大便次数增多、不成形，还可能伴有心悸、多汗、消瘦等症状。发病与遗传、自身免疫等因素有关，遗传因素使个体具有易感性，自身免疫异常导致甲状腺过度分泌甲状腺激素。任何年龄均可发病，以20-40岁多见，女性发病率高于男性。
（二）糖尿病
糖尿病患者如果血糖控制不佳，可引起自主神经病变，导致肠道自主神经功能紊乱，影响肠道的正常运动和分泌功能，出现大便不成形，可表现为腹泻或便秘，也可两者交替出现。发病与遗传、环境等因素有关，遗传因素决定了个体的易患倾向，环境因素如高热量饮食、缺乏运动等可诱发糖尿病。各个年龄均可发病，随着人口老龄化及生活方式的改变，发病率逐渐升高。
四、其他原因
（一）药物因素
某些药物可引起大便不成形，如抗生素，长期或广谱使用抗生素可导致肠道菌群失调，有益菌减少，有害菌大量繁殖，影响肠道正常功能，引起大便不成形。不同药物有不同的适用人群和禁忌人群，例如儿童使用某些抗生素需要特别注意剂量和疗程，避免引起严重的肠道菌群失调。
（二）食物不耐受
例如乳糖不耐受，一些人由于体内缺乏乳糖酶，无法正常消化乳制品中的乳糖，食用乳制品后可出现腹胀、腹泻、大便不成形等症状。各个年龄均可发生，儿童中相对常见，有些人随着年龄增长，乳糖酶活性降低，也可出现乳糖不耐受。