睡醒后肩膀后面酸疼，可能与以下原因有关：
1.睡姿不良：如果睡觉时枕头高度不合适、床垫过软或过硬，或者睡觉时保持同一姿势时间过长，都可能导致肩膀后面的肌肉和关节受到压迫，引起酸疼。
2.肌肉劳损：如果平时经常进行重体力劳动或体育运动，或者长时间保持同一姿势，可能导致肩膀后面的肌肉劳损，睡醒后出现酸疼的症状。
3.肩周炎：肩周炎是一种常见的肩关节疾病，主要表现为肩关节疼痛和活动受限。在肩周炎的早期，可能会出现睡醒后肩膀后面酸疼的症状。
4.颈椎病：颈椎病是一种常见的脊柱疾病，如果颈椎间盘突出或骨质增生压迫神经根，可能会导致肩膀后面、上肢等部位出现疼痛、麻木等症状。
5.其他原因：心血管疾病、呼吸系统疾病等也可能导致肩膀后面酸疼。
如果睡醒后肩膀后面酸疼的症状持续时间较长或症状加重，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，应注意保持良好的睡姿和坐姿，避免长时间保持同一姿势，适当进行体育锻炼，注意保暖等。