发烧39度时，可以采取以下物理降温方法：
1.温水擦浴：用32℃~34℃的温水擦拭患者皮肤，尤其是颈部、腋窝、肘窝、腹股沟等血流丰富的部位。但要注意，不要擦拭前胸、后背、手心、脚心等部位，以免引起不良反应。
2.冷敷：在额头、颈部两侧、腋窝、肘窝等部位放置冰袋或冷毛巾，也可以使用退热贴。但要注意，冷敷时间不宜过长，以免冻伤皮肤。
3.多喝水：发烧会导致身体水分流失，多喝水可以补充水分，促进新陈代谢，有助于降温。
4.酒精擦浴：酒精擦浴是一种传统的物理降温方法，但由于酒精可能通过皮肤吸收，对身体造成一定的危害，目前已经不推荐使用。
5.降低环境温度：保持室内空气流通，适当降低环境温度，也有助于降温。
需要注意的是，如果发烧39度持续时间较长，或者伴有其他症状，如咳嗽、咳痰、头痛、呕吐等，应及时就医，以免延误病情。此外，在进行物理降温的同时，应注意保持患者的舒适和安全，避免过度降温导致身体不适。如果患者症状严重或体温持续升高，应及时就医，并在医生的指导下使用退烧药。