手指甲凹凸不平，可能是以下原因导致的：
1.灰指甲：由真菌感染引起，会导致指甲变形、增厚、变色、凹凸不平等。
2.银屑病：是一种慢性炎症性皮肤病，可累及指甲，导致指甲出现凹陷、凸起、变色等异常。
3.扁平苔藓：病因尚不明确，可能与免疫、感染、遗传等因素有关，可导致指甲出现纵行条纹、沟纹、纵嵴、甲分离等。
4.斑秃：病因尚不清楚，可能与遗传、自身免疫、精神因素等有关，可导致头发和指甲出现异常。
5.营养不良：如缺铁、缺锌等，可影响指甲的正常生长，导致指甲凹凸不平。
6.其他：某些系统性疾病（如心脏病、糖尿病）、长期接触化学物质、外伤等也可能引起指甲凹凸不平。
如果发现手指甲凹凸不平，建议及时就医，明确原因，并进行针对性治疗。同时，要注意保持指甲清洁卫生，避免过度修剪，避免接触刺激性物质。