病毒与细菌在结构、大小、繁殖方式等方面存在差异。病毒无细胞结构，需依赖宿主细胞繁殖；细菌有细胞结构，可独立生存繁殖。
一、结构方面
病毒结构简单，主要由核酸（DNA或RNA）和蛋白质外壳组成；细菌有完整细胞结构，具备细胞壁、细胞膜、细胞质等结构，部分细菌还有特殊结构如荚膜、鞭毛等。
二、大小差异
病毒非常微小，多数病毒直径在20~200纳米，需借助电子显微镜才能观察；细菌相对较大，直径一般在0.5~5微米，光学显微镜下可看到。
三、繁殖方式
病毒必须寄生在活细胞内，利用宿主细胞的物质和能量，以自我复制的方式繁殖；细菌主要通过二分裂的方式进行无性繁殖，在适宜环境中可快速增殖。
四、对药物的敏感性
细菌感染可选用抗生素等药物治疗，抗生素能抑制或杀灭细菌；病毒感染时，抗生素通常无效，需使用抗病毒药物，但抗病毒药物相对有限，且部分病毒感染有自限性。对于儿童等特殊人群，病毒或细菌感染时需更谨慎对待，儿童免疫系统尚不完善，感染后应及时就医，由医生根据具体情况判断并给予恰当处理，避免自行盲目用药。