牙根部发黑可能是以下原因引起的：
1.龋齿：如果牙齿龋坏，细菌会分解食物中的糖分产生酸，导致牙齿脱矿，形成龋洞。龋坏进展到牙根部时，会使牙根部的牙釉质和牙本质受到破坏，从而出现黑色或棕色的斑块。
2.牙髓坏死：牙髓是位于牙齿内部的软组织，包含血管、神经和细胞。当牙髓受到感染或损伤时，牙髓组织会坏死，细菌和分解产物会从根管中泄漏出来，导致牙根周围组织发炎，进而使牙齿根部变黑。
3.外源性色素沉着：长期吸烟、喝咖啡、喝茶或食用某些药物（如铁剂）等，可能会使色素沉着在牙齿表面或牙缝中。如果这些习惯没有及时清除，色素可能会逐渐渗透到牙齿内部，导致牙根部发黑。
4.牙外伤：牙齿受到外力撞击或突然的咬合力，可能会导致牙根周围的血管破裂，引起淤血。淤血中的血红蛋白分解后会产生黑色素，使牙齿根部看起来发黑。
5.四环素牙或氟斑牙：在牙齿发育期间，服用了四环素类药物或长期生活在高氟地区，可能会导致牙齿出现四环素牙或氟斑牙。这两种情况都可能使牙齿表面呈现不均匀的棕色或黑色斑块，包括牙根部。
6.牙釉质发育不全：如果在牙齿发育过程中出现异常，如钙、磷代谢障碍或维生素缺乏等，可能会导致牙釉质发育不全，使牙齿变得脆弱、易着色，从而出现牙根部发黑的现象。
如果发现牙根部发黑，建议及时就医，医生会根据具体情况进行详细的口腔检查和诊断，并制定相应的治疗方案。治疗方法可能包括补牙、根管治疗、牙齿美白等。此外，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙，及时治疗口腔疾病，对于预防牙齿发黑也非常重要。