男生上厕所小便刺痛能否自愈，需要根据具体情况进行分析，具体如下：
1.生理因素：如果是由于饮水过少、尿液浓缩导致的小便刺痛，通常通过增加饮水量、保持尿道口清洁，可使症状得到缓解。
2.炎症：如果是由于尿道炎、膀胱炎等炎症引起的小便刺痛，通常不能自愈，需要使用抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。
3.结石：如果是由于尿路结石导致的小便刺痛，较小的结石可能会通过排尿自行排出体外，症状得到缓解，但较大的结石通常需要进行体外冲击波碎石或手术治疗。
4.其他：如果是由于前列腺炎、前列腺增生等疾病引起的小便刺痛，通常需要进行针对性治疗，如使用坦索罗辛、非那雄胺等药物，或进行手术治疗。
需要注意的是，男生上厕所小便刺痛可能是多种原因引起的，如果症状持续不缓解或伴有其他症状，如尿频、尿急、血尿等，应及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间应注意保持尿道口清洁，避免憋尿、久坐，避免食用辛辣刺激性食物。