孩子早晨起来咳嗽，可能是以下原因导致的：
1.夜间呼吸道分泌物增加：孩子在睡眠时，呼吸道分泌物会积聚在喉咙和气管中，早晨起床后，体位改变，分泌物刺激咽喉部，引起咳嗽。
2.过敏：孩子对室内的尘螨、花粉、动物毛发等过敏，早晨起床后，接触过敏原，可引起咳嗽。
3.上气道咳嗽综合征：孩子患有鼻炎、鼻窦炎等疾病，鼻腔分泌物倒流刺激咽喉部，可引起咳嗽。
4.胃食管反流：孩子的胃容量较小，平卧时容易发生胃食管反流，胃酸反流刺激咽喉部，可引起咳嗽。
5.感染后咳嗽：孩子在呼吸道感染后，气道黏膜受损，敏感性增加，可导致咳嗽持续一段时间。
针对孩子早晨起来咳嗽的情况，可以采取以下治疗方法：
1.保持室内空气湿润：可以使用加湿器增加室内空气湿度，减轻呼吸道刺激。
2.调整孩子的睡眠姿势：可以将孩子的头部垫高，减少反流的发生。
3.及时清理鼻腔分泌物：可以使用吸鼻器或生理盐水滴鼻，帮助孩子清理鼻腔分泌物。
4.避免接触过敏原：如果孩子对过敏原过敏，要尽量避免接触过敏原，如尘螨、花粉等。
5.治疗原发病：如果孩子咳嗽是由于鼻炎、鼻窦炎等疾病引起的，要及时治疗原发病。
6.药物治疗：如果孩子咳嗽严重，可以在医生的指导下使用止咳药物。
总之，如果孩子早晨起来咳嗽持续时间较长或伴有其他症状，如发热、喘息等，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。