早晨起来咳嗽可能由多种原因引起。比如，过敏性鼻炎患者在夜间睡觉时，鼻腔分泌物可能倒流至咽喉，早晨起床后就会刺激咳嗽，这类人群占因早晨咳嗽就诊人群的一定比例。
环境因素导致的早晨咳嗽
室内空气干燥： 如果室内空气湿度较低，低于40% - 60%的适宜范围，早晨起来时干燥的空气会刺激呼吸道黏膜，引发咳嗽。建议使用加湿器，将室内湿度保持在40% - 60%之间。室内有过敏原： 像尘螨、花粉等过敏原，如果夜间在室内积聚，早晨起来接触到就可能引起咳嗽。例如，尘螨喜欢生活在床垫、枕头等地方，定期清洗床上用品，使用防螨床品能减少尘螨引发的早晨咳嗽。
呼吸道疾病引发的早晨咳嗽
慢性支气管炎： 慢性支气管炎患者早晨起来时，气管内的分泌物会增多，刺激气管引发咳嗽，一般咳嗽时间较长，可能持续3个月以上，连续2年发作。患者需要注意保暖，避免吸入刺激性气体。咽炎： 慢性咽炎患者咽喉部黏膜处于敏感状态，早晨起来时，咽喉部可能因夜间分泌物的刺激而咳嗽，可能还伴有咽部异物感。要注意清淡饮食，避免过度用嗓。
胃食管反流引起的早晨咳嗽
夜间胃酸反流： 一些人存在胃食管反流情况，夜间平卧时胃酸可能反流至食管，甚至到达咽喉部位，早晨起来就会刺激咳嗽。这类人群要注意睡前3小时不要进食，睡觉时可将床头抬高15 - 20厘米，减少胃酸反流。