怀孕49天内可以选择药物流产。
药物流产是指通过服用药物终止早期妊娠，其适用范围是终止49日以内的妊娠，即从末次月经的第一天算起的39～49天内。药物流产的优点是避免手术流产的疼痛及发生某些并发症，达到有孕止孕、无孕催经的目的。但药物流产也有一定的风险，存在药流不全的可能，需要再次清宫；药物流产后出血时间较长，平均为18～20天，甚至更长时间，长期出血可能导致贫血、感染等。
因此，在决定采用药物流产前，需要进行全面的身体检查和评估，包括B超检查以确定孕囊的位置和大小、血常规、白带常规、心电图等，以排除药物流产的禁忌证。同时，需要在医生的指导下进行药流，并在药流后密切观察身体状况，如有异常及时就医。