小便时尿道刺痛可能是尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等疾病引起的，需要根据具体病因选择合适的药物治疗，以下是一些常用的药物：
1.抗生素：如果是细菌感染引起的尿道炎、膀胱炎等，可使用抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。使用抗生素时需遵循医生的建议，按照剂量和疗程服用，避免滥用抗生素导致耐药。
2.抗炎药：如果是炎症引起的尿道刺痛，可使用抗炎药缓解症状，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
3.中成药：一些中成药也可用于治疗尿道刺痛，如三金片、热淋清颗粒等，具有清热解毒、通淋利尿的作用。
4.其他药物：对于前列腺疾病引起的尿道刺痛，还可使用α受体阻滞剂、5-α还原酶抑制剂等药物进行治疗，如坦索罗辛、非那雄胺等。
需要注意的是，尿道刺痛可能是多种疾病的症状之一，治疗药物也有所不同。在使用药物治疗前，应及时就医，进行相关检查，明确病因，在医生的指导下选择合适的药物进行治疗。同时，在治疗期间应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物，有助于病情的恢复。此外，对于孕妇、哺乳期妇女、儿童、老年人等特殊人群，使用药物需谨慎，应在医生的指导下使用。