小便时尿道刺痛可能是尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等泌尿系统感染引起的，也可能是尿路结石、肿瘤等其他疾病导致的。治疗药物需要根据具体病因来选择，以下是一些可能有效的药物：
1.抗生素：如果是细菌感染引起的尿道炎、膀胱炎等，常用的抗生素有头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。使用抗生素需要遵医嘱，按照疗程服用，不要自行停药，以免病情复发或产生耐药性。
2.解热镇痛药：如果尿痛症状比较明显，可以使用解热镇痛药来缓解疼痛，如对乙酰氨基酚、布洛芬等。
3.其他药物：如果是膀胱炎引起的尿急、尿痛，可以使用M受体拮抗剂，如托特罗定、索利那新等；如果是前列腺炎引起的，可以使用α受体阻滞剂，如坦索罗辛、特拉唑嗪等。
需要注意的是，以上药物都需要在医生的指导下使用，不能自行用药。此外，除了药物治疗外，还需要注意个人卫生，多喝水，多排尿，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，进行相关检查，明确病因，以便进行针对性治疗。