酶并不都是蛋白质，而是具有催化活性的有机物，其中大部分是蛋白质，但还有一小部分是RNA。
酶根据其分子结构的不同，可以分为单纯酶和结合酶。单纯酶的分子中只有氨基酸残基组成的肽链，而结合酶则由蛋白质部分和非蛋白质部分组成，其中蛋白质部分称为酶蛋白，非蛋白质部分称为辅助因子。
酶蛋白决定了酶的催化特异性和催化活性，而辅助因子则参与酶的催化过程，并影响酶的催化效率、稳定性和特异性。
虽然大部分酶是蛋白质，但近年来也发现了一些具有催化活性的RNA，这些RNA被称为核酶，它们可以在没有蛋白质的情况下催化特定的化学反应。
因此，酶不一定都是蛋白质，还包括一些具有催化活性的RNA。