小便后用纸擦有褐色分泌物，可能是以下原因引起的：
1.生理性原因：
月经间期出血：如果正处于两次月经中间，可能是排卵期出血，出血量较少时可表现为褐色分泌物。
怀孕相关：先兆流产、异位妊娠、生化妊娠等情况也可能导致小便后用纸擦有褐色分泌物。
口服避孕药：部分女性口服避孕药后，可能出现突破性出血，表现为小便后用纸擦有褐色分泌物。
2.病理性原因：
阴道炎：阴道炎可导致阴道黏膜充血、水肿，分泌物增多，有时可表现为褐色分泌物。
宫颈炎：宫颈炎可导致宫颈黏膜充血、水肿，甚至糜烂，同房或妇科检查后可能出现褐色分泌物。
子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是一种良性病变，可导致子宫不规则出血，表现为褐色分泌物。
子宫肌瘤：黏膜下子宫肌瘤可导致子宫腔面积增大，子宫收缩不良，引起月经淋漓不尽，表现为褐色分泌物。
其他：子宫内膜异位症、宫颈癌、子宫内膜癌等也可能导致小便后用纸擦有褐色分泌物。
如果出现小便后用纸擦有褐色分泌物的情况，建议及时就医，进行相关检查，如白带常规、妇科超声、血HCG等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免性生活和盆浴。