阴茎里面隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的因素：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可导致阴茎疼痛、尿频、尿急等症状。尿道炎通常由细菌感染引起，如淋病奈瑟菌、沙眼衣原体等。
2.前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，可引起阴茎根部、会阴部、耻骨上区等部位的疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、排尿困难等症状。
3.阴茎硬结症：阴茎硬结症是一种病因不明的疾病，主要表现为阴茎海绵体纤维化，形成斑块，导致阴茎弯曲、疼痛。
4.阴茎损伤：阴茎受到外力撞击、挤压、切割等损伤时，可引起疼痛。
5.精索静脉曲张：精索静脉曲张是精索内蔓状静脉丛的异常扩张、伸长和迂曲，可导致阴囊内坠胀不适，并可向腹股沟区放射，有时还会影响阴茎的勃起和射精功能。
6.其他原因：包茎、包皮过长、附睾炎、精囊炎、尿道结石等也可能引起阴茎疼痛。
需要注意的是，阴茎疼痛可能是严重疾病的症状，如阴茎癌、膀胱癌等，因此，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如排尿困难、血尿、发热等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因，并采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如老年人、糖尿病患者、免疫功能低下者等，阴茎疼痛可能与其他疾病有关，如糖尿病性神经炎、血管性疾病等，因此需要更加重视，并及时就医。
总之，阴茎里面隐隐作痛可能是多种疾病的表现，需要引起重视。如果出现这种情况，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，保持阴茎清洁，避免过度性生活和手淫等。