孩子反复发烧，高烧39度，可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况和建议：
1.感染：这是最常见的原因，如病毒、细菌、支原体等感染都可能导致发热。可以观察孩子除了发热，是否还有其他症状，如咳嗽、流涕、喉咙痛、腹泻等。如果有，需要及时就医，医生可能会根据症状和检查结果，开一些抗生素或抗病毒药物。如果孩子精神状态还好，可以先在家观察，多喝水，注意休息，使用物理降温的方法，如温水擦浴、冷敷额头等。如果孩子体温持续不降或升高，或者出现精神萎靡、呼吸急促等异常情况，应立即就医。
2.免疫系统问题：孩子的免疫系统尚未完全发育成熟，可能会对某些抗原产生过度反应，导致自身免疫性疾病，如幼年特发性关节炎、系统性红斑狼疮等。这些疾病除了发热，还可能伴有皮疹、关节痛、脱发等症状。如果孩子有反复发热的病史，或者家族中有自身免疫性疾病的患者，需要及时就医，进行相关的检查和治疗。
3.恶性肿瘤：虽然儿童恶性肿瘤的发生率相对较低，但也不能忽视。某些白血病、淋巴瘤等血液系统肿瘤，以及神经母细胞瘤、肾母细胞瘤等实体瘤都可能导致发热。这些肿瘤通常还会伴有其他症状，如贫血、出血、肿块、骨痛等。如果孩子有不明原因的发热，且经过抗感染治疗无效，或者伴有其他异常表现，需要及时就医，进行骨髓穿刺、影像学等检查，以排除恶性肿瘤的可能。
4.其他原因：除了上述原因，孩子反复发烧，高烧39度，还可能与药物过敏、中暑、川崎病、斯蒂尔病等有关。这些情况相对较少见，但也需要引起重视。
总之，孩子反复发烧，高烧39度，需要引起家长的重视，及时就医，明确病因，以便进行针对性的治疗。在就医前，家长可以先给孩子测量体温，观察孩子的精神状态，记录孩子的症状和用药情况等，以便给医生提供更多的信息。同时，家长要注意给孩子多喝水，保持室内通风，避免过度保暖。