阴茎根部里面隐隐阵痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.前列腺炎或精囊炎：这两种疾病可能导致阴茎根部疼痛，同时还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。建议及时就医，进行前列腺液或精液检查，以明确诊断，并接受相应的治疗。
2.尿道炎：尿道炎也可能引起阴茎根部疼痛，同时可能伴有尿道口红肿、分泌物增多等症状。治疗方法包括使用抗生素等药物。
3.阴茎硬结症：阴茎硬结症是一种结缔组织疾病，可能导致阴茎勃起时疼痛，阴茎根部也可能有隐痛。目前尚无特效治疗方法，可通过局部注射、物理治疗等方法缓解症状。
4.精索静脉曲张：精索静脉曲张可能导致阴囊和阴茎根部的坠胀和疼痛，有时也可能放射到腹股沟区。严重的精索静脉曲张可能影响生育能力，需要及时就医，根据病情选择药物治疗、手术治疗等方法。
5.其他原因：阴茎根部疼痛还可能与外伤、阴茎感染、阴茎血管病变等因素有关。
总之，阴茎根部里面隐隐阵痛可能是多种疾病的表现，需要及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，注意个人卫生，避免过度性生活，保持良好的生活习惯，有助于缓解症状和预防疾病的发生。
对于特殊人群，如老年人、糖尿病患者、免疫功能低下者等，阴茎根部疼痛可能提示更严重的健康问题，应更加重视并及时就医。此外，如果疼痛持续不缓解或加重，或伴有其他异常症状，如发热、排尿困难、勃起功能障碍等，应立即就医。在就医过程中，应如实告知医生症状的发生时间、频率、加重或缓解因素等情况，以便医生做出准确的诊断和治疗建议。