女士小便时尿道刺痛出血且腰痛，可能由以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，常由细菌感染引起。除了尿痛、尿血外，还可能伴有尿频、尿急等症状。尿道炎可通过性行为传播，此外，使用刺激性的阴道清洁剂、憋尿时间过长等也可能导致尿道炎。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也常由细菌感染引起。除了尿痛、尿血外，还可能伴有尿频、尿急、下腹疼痛等症状。憋尿时间过长、膀胱结石等也可能导致膀胱炎。
3.肾盂肾炎：肾盂肾炎是肾盂和肾实质的炎症，常由细菌感染引起。除了尿痛、尿血外，还可能伴有寒战、高热、腰痛等症状。糖尿病、尿路梗阻等是肾盂肾炎的高危因素。
4.泌尿系统结石：如肾结石、输尿管结石等，可导致尿路梗阻，引起尿痛、尿血和腰痛。此外，还可能伴有恶心、呕吐等症状。
5.泌尿系统肿瘤：如膀胱癌、肾癌等，也可导致尿痛、尿血和腰痛。此外，还可能伴有消瘦、乏力等症状。
6.其他原因：如尿道口息肉、尿道憩室等，也可能导致尿痛、尿血和腰痛。
如果女士出现小便时尿道刺痛出血且腰痛的情况，建议及时就医，进行相关检查，如尿液检查、超声检查等，以明确病因，并进行针对性治疗。此外，在就医前应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，同时避免性生活，以免加重病情。