大便出血肛门痛可能由多种病因引起，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵裂后形成的小溃疡，常引起肛门疼痛、便血。
肛管皮肤弹性较差、血供较差、肛腺分泌不足，造成肛管易损伤且不易修复，是肛裂形成的主要原因。
干硬的粪便或外界暴力可能导致肛管皮肤损伤，继而感染形成溃疡。
便秘、肛管狭窄、内括约肌痉挛等也可导致肛裂。
患者会感到肛门疼痛，呈周期性，多在大便时或大便后加重，疼痛剧烈者可影响睡眠。
同时还会伴有便血，血色鲜红，量不多。
2.痔疮：肛管或直肠下端静脉充血肿大所致，可分为内痔、外痔、混合痔。
肛垫下移学说认为痔的形成与肛垫下移有关，痔的本质是肛垫病理性肥大、移位及肛周皮下血管丛血流淤滞形成的局部团块。
静脉曲张学说认为痔是直肠下段黏膜下和肛管皮肤下的静脉丛淤血、扩张和屈曲所形成的静脉团。
便秘、长期饮酒、进食大量刺激性食物和久坐久立是痔疮的常见诱因。
内痔一般无疼痛，以便血、痔核脱出为主要症状，严重时会出现喷射状出血，血色鲜红。
外痔位于齿线以下，一般无明显症状，发生血栓及炎症时可有肿胀、疼痛。
混合痔则具备内痔、外痔的双重特点。
3.肛管或直肠损伤：多由外物或器械损伤肛管直肠所致，常伴有肛门疼痛及便血。
4.直肠、结肠炎症：炎症性肠病、感染性肠炎等均可导致直肠、结肠黏膜受损，引起便血、肛门疼痛。
5.直肠、结肠癌：此类恶性肿瘤可导致大便习惯改变、黏液脓血便、腹痛、肛门坠胀等症状。
6.其他：肛门直肠肛管良性肿瘤、肛管及直肠狭窄、肛瘘、肛裂等均可引起大便出血肛门痛。此外，一些全身性疾病，如白血病、血小板减少性紫癜、尿毒症等，也可能导致肛门痛并伴有出血。
总之，大便出血肛门痛的原因较为复杂，可能是肛肠疾病，也可能是其他系统疾病的表现。如果出现此类症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。