根据你提供的信息，舌根疼、咽口水疼可能是由以下原因引起：
1.扁桃体炎：扁桃体炎是腭扁桃体的非特异性炎症，可分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎。急性扁桃体炎主要表现为咽痛，多伴有吞咽困难，还可能伴有发热、头痛、周身不适、食欲减退等全身症状；慢性扁桃体炎多无明显自觉症状，有时可有咽干、异物感、刺激性咳嗽等症状。
2.咽炎：咽炎可分为急性咽炎和慢性咽炎。急性咽炎起病急，主要表现为咽部干燥、灼热、疼痛，吞咽时加重，可伴有发热、头痛、食欲不振等全身症状；慢性咽炎多表现为咽部异物感、痒感、灼热感、干燥感或微痛感，常有黏稠分泌物附着于咽后壁，使患者晨起时出现刺激性咳嗽，伴恶心。
3.口腔溃疡：口腔溃疡是一种常见的口腔黏膜溃疡性损伤，可发生在口腔黏膜的任何部位，以唇、颊、舌部多见，可单发或多发，具有周期性、复发性、自限性的特征，一般7~10天可自愈。口腔溃疡发作时，疼痛剧烈，影响进食、说话等。
4.其他：舌根疼、咽口水疼还可能与舌咽神经痛、扁桃体周围脓肿、会厌炎等疾病有关。
如果出现舌根疼、咽口水疼的症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，在治疗期间应注意保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物，多喝水，注意休息。