咳嗽时耳朵疼，通常是由于耳部和喉部的神经存在关联，咳嗽的强烈刺激可通过神经传导，引起耳部疼痛。除此之外，还有可能是其他原因引起，具体如下：
1.耳部感染：如外耳道炎、中耳炎等，咳嗽会导致耳部压力变化，从而引起疼痛。
2.咽鼓管功能障碍：咽鼓管是连接中耳和咽部的通道，咳嗽时可能导致咽鼓管功能异常，使中耳内的压力失衡，引起耳部疼痛。
3.鼻部疾病：如鼻炎、鼻窦炎等，鼻部炎症可能影响咽鼓管功能，导致中耳负压，从而引起耳部疼痛。
4.喉部疾病：喉部的炎症、声带息肉等也可能引起咳嗽，同时牵扯到耳部神经，导致耳部疼痛。
5.其他原因：如颞下颌关节紊乱、神经痛等也可能出现此类症状。
如果咳嗽时耳朵疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如听力下降、耳鸣、发热等，建议及时就医，进行相关检查，如耳镜检查、听力测试等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在咳嗽时，可以尝试用嘴巴呼吸，减轻耳部压力，缓解疼痛。此外，保持耳部清洁，避免用力擤鼻、挖耳等，也有助于预防耳部疼痛的发生。