大拇指根部肉厚部分疼可能是由于拇囊炎、腱鞘炎、类风湿关节炎、痛风等原因引起的。可以通过休息、冷敷、药物治疗（如非甾体抗炎药、糖皮质激素）、物理治疗（如超声波、电疗）、手术治疗等方式进行治疗，建议及时就医，明确病因后进行针对性治疗。具体分析如下：
1.拇囊炎：可能与遗传、穿鞋不当、过度运动等因素有关。表现为大拇指根部疼痛、肿胀、发红等。治疗方法包括休息、冷敷、穿戴合适的鞋子、使用止痛药、物理治疗等。如果病情严重，可能需要手术治疗。
2.腱鞘炎：由于长期过度使用手部或手指，导致腱鞘发生炎症。常见于拇指根部。治疗方法包括休息、冷敷、使用止痛药、物理治疗、腱鞘内注射类固醇药物等。如果保守治疗无效，可能需要手术治疗。
3.类风湿关节炎：一种自身免疫性疾病，可侵犯全身多个关节，包括拇指根部。除了疼痛，还可能伴有肿胀、晨僵、关节畸形等症状。治疗方法包括药物治疗（如非甾体抗炎药、抗风湿药、生物制剂）、物理治疗、手术治疗等。同时，患者需要注意休息，避免劳累和受寒。
4.痛风：血尿酸水平升高导致尿酸盐结晶沉积在关节内引起的炎症。拇指根部是痛风的好发部位之一。除了疼痛，还可能伴有红肿、发热等症状。治疗方法包括饮食控制、药物治疗（如秋水仙碱、非甾体抗炎药、糖皮质激素）等。如果痛风石较大，可能需要手术治疗。
5.其他：拇指根部肉厚部分疼还可能与感染、肿瘤、创伤等因素有关。
患者在治疗期间需要注意休息，避免过度使用手部或手指。可适当食用富含维生素C、维生素D、钙等营养物质的食物，如新鲜蔬菜、水果、奶制品等。避免食用高嘌呤食物，如动物内脏、海鲜、肉汤等。同时，患者需要及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。