肛瘘主要症状有肛周反复流脓，一般瘘管较细时，脓液量少，可为稀薄的血性分泌物，若瘘管较粗，脓液量会增多，有时呈脓性、黏液性。部分患者肛周会有瘙痒感，因为脓液流出刺激肛周皮肤，长期如此可致肛周皮肤潮湿、瘙痒，甚至出现湿疹样改变。还有疼痛表现，当肛瘘通畅时，一般疼痛较轻，但当瘘管不畅，脓液引流受阻时，会出现疼痛，可为胀痛、跳痛等，行走、排便时可能加重。
流脓情况详述
间歇性流脓： 很多肛瘘患者会出现间歇性流脓现象。在瘘管通畅时，脓液排出相对顺利，流脓量较少，间隔时间较长；而当身体抵抗力下降等情况出现时，瘘管可能会堵塞，此时脓液积聚，流脓量增多，间隔时间缩短。例如有些患者可能几天流脓一次，而在身体劳累等情况下可能1 - 2天就会流脓一次。脓液性状： 脓液的性状也有不同。初期脓液往往比较浓稠，颜色偏黄，可能还带有臭味；随着病情发展，若合并感染等情况，脓液可能变得稀薄，颜色可能呈灰白色等。
肛周瘙痒细节
瘙痒程度差异： 肛周瘙痒程度因人而异。有的患者只是轻微瘙痒，不影响日常生活；而有的患者瘙痒非常严重，会忍不住搔抓肛周皮肤，严重影响睡眠和生活质量。一般来说，肛瘘导致的瘙痒是持续存在的，而且在脓液流出刺激肛周皮肤时瘙痒会加重。皮肤改变： 由于长期搔抓，肛周皮肤会出现一些改变，如皮肤增厚、粗糙，颜色可能加深，还可能出现皲裂等情况。有些患者因为搔抓过度，甚至会引起肛周皮肤破损、出血等。
疼痛相关要点
疼痛诱因： 疼痛的诱因主要是瘘管的通畅情况。当瘘管堵塞时，肛门腺分泌的液体无法正常排出，在腺体内积聚，就会引起疼痛。比如患者久坐、久站或者排便时，由于局部压力变化等因素，会刺激到堵塞的瘘管，从而引发疼痛。疼痛性质与缓解： 疼痛性质多样，胀痛是比较常见的，感觉肛门周围有胀满的疼痛；跳痛则像心脏跳动一样有节律的疼痛。当脓液排出，瘘管通畅后，疼痛会逐渐缓解。但如果再次出现瘘管堵塞情况，疼痛又会复发。