三个月的宝宝喉咙里有痰，可能是生理现象，也可能是疾病导致。以下是一些建议：
1.调整宝宝体位：将宝宝竖着抱起或侧卧，有助于痰液排出。
2.拍背：空心掌轻轻拍打宝宝背部，由下往上，从外向内，帮助痰液松动。
3.适当喂水：可以湿润宝宝的喉咙，促进痰液咳出。
4.保持空气湿润：使用加湿器增加空气湿度，有助于缓解喉咙不适。
5.观察宝宝情况：如果宝宝呼吸急促、咳嗽加剧、精神状态不佳，或出现发热等症状，应及时就医。
6.就医治疗：在医生的指导下，使用祛痰药物或进行雾化治疗。
需要注意的是，不要自行给宝宝使用药物，尤其是抗生素。如果对宝宝的情况有任何疑虑，最好咨询医生的意见。同时，要保持宝宝的口腔清洁，及时清理口腔内的分泌物。