大便出血肛门有疼痛感可能是肛裂、痔疮、肛管或直肠肿瘤等肛肠疾病引起的，也可能是某些肠道炎症或全身性疾病在肛肠局部的表现。以下是一些可能的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型症状是肛门疼痛、便血和便秘。
肛门疼痛：多剧烈，有典型的周期性。排便时肛裂裂口内神经末梢受刺激，引起肛管内烧灼样或刀割样疼痛，便后数分钟可缓解，称为疼痛间歇期。随后因肛门括约肌收缩痉挛，再次剧痛，可持续数小时至十余小时，此时患者会坐卧不安，难以忍受，直至括约肌疲劳后，肌肉松弛，疼痛缓解。但再次排便时，疼痛又会出现。
便血：一般出血量较少，呈鲜红色，有时便后手纸带血或滴血。
便秘：患者因肛门疼痛不愿排便，久而久之引起便秘，粪便更为干硬，便秘又可使肛裂加重，形成恶性循环。
2.痔疮：内痔或混合痔发展到一定程度即能脱出肛门外，内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，则有不同程度的疼痛。
便血：内痔或混合痔一般无疼痛，便血是内痔或混合痔的常见症状，呈鲜红色，排便时滴血或喷射状出血。
脱出：内痔或混合痔发展到一定程度即能脱出肛门外。
肛门瘙痒：由于内痔或混合痔经常脱出，致使肛门括约肌松弛，黏液流出肛门外刺激皮肤，而导致肛门瘙痒和湿疹。
3.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，早期即可出现便血，血色鲜红或暗红，量不多，伴有肛门部坠胀、不适或隐痛等症状。随着肿瘤的进展，可出现肛门部疼痛、肿块、大便习惯或形状改变等症状。
4.肠道炎症：如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，可导致肠道黏膜炎症、溃疡形成，出现腹痛、腹泻、脓血便等症状，同时也可伴有肛门部疼痛。
5.全身性疾病：如白血病、血小板减少性紫癜等，可因凝血功能异常导致皮肤黏膜出血，也可出现大便带血，伴有肛门部疼痛。
总之，大便出血肛门有疼痛感的原因较多，可能是肛肠疾病，也可能是肠道炎症或全身性疾病引起。如果出现这种症状，应及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。此外，保持良好的生活习惯，如饮食清淡、多吃蔬菜水果、避免久坐久立、养成定时排便的习惯等，有助于预防肛肠疾病的发生。