头痛发作时要积极寻找原因，针对病因进行相应的治疗。如果为原发性偏头痛主要是给予对症治疗，轻症患者可以口服布洛芬、萘普生、吲哚美辛，严重时也可以应用麦角胺咖啡因、佐米曲普坦和舒马普坦治疗。
丛集性头痛的患者主要应用佐米曲普坦、舒马普坦;紧张性头痛的患者可给予心理疏导治疗，比如让患者放松心情，减轻压力，也可以口服对乙酰氨基酚和布洛芬对症止痛治疗。
如果患者为继发性头痛，常见的疾病包括颅脑外伤、中枢神经系统感染、脑血管疾病，包括脑出血和蛛网膜下腔出血以及颅脑肿瘤。
颅脑肿瘤的患者主要应住院进行手术和放射治疗;颅脑外伤的治疗，患者必要时可以到骨科进行治疗;中枢神经系统感染包括脑炎和脑膜炎，脑炎的患者主要应用抗病毒、降颅压和神经保护治疗;脑膜炎的患者主要给予抗炎治疗，必要时也可给予降颅压以及神经保护治疗，脑血管疾病包括脑出血和蛛网膜下腔出血，如果有手术适应症尽量给予手术治疗。
无手术指征的情况下也可以保守治疗，包括降颅压治疗以及神经保护治疗，预防并发症的治疗。