五个月大的婴儿在睡觉时经常摇头，可能由以下原因引起：
1.正常的生理现象：
神经系统发育不完善：五个月大的婴儿神经系统尚未完全发育成熟，睡觉时可能会出现不自主的摇头、四肢抖动等动作，这是正常的生理现象，随着婴儿的成长，这种现象会逐渐减少并消失。
浅睡眠状态：婴儿在浅睡眠时，大脑皮层的兴奋性较低，容易受到外界刺激的影响，从而出现摇头、微笑、皱眉等动作。当婴儿进入深睡眠后，这些动作会逐渐消失。
2.环境因素：
过热或过冷：如果婴儿睡觉时所处的环境温度过高或过低，可能会导致他们感到不适，从而出现摇头、烦躁等表现。家长可以通过触摸婴儿的后颈部来判断其体温是否正常，以调整室内温度。
噪音或光照：过于嘈杂的环境或强烈的光线刺激也可能影响婴儿的睡眠，导致他们出现摇头、哭闹等现象。家长可以为婴儿创造一个安静、舒适的睡眠环境，如调整室内温度、关闭噪音源、拉上窗帘等。
衣物或被褥不适：如果婴儿睡觉时穿着过多或过少的衣物，或者被褥过厚或过硬，可能会影响他们的睡眠舒适度，导致他们出现摇头、翻身等动作。家长可以根据季节和室内温度为婴儿选择合适的衣物和被褥。
3.皮肤问题：
湿疹：湿疹是婴儿常见的皮肤问题之一，可能会导致皮肤瘙痒，从而引起婴儿摇头。湿疹通常还会伴有皮肤发红、脱屑等症状。家长可以咨询医生，选择合适的湿疹治疗方法。
痱子：如果婴儿出汗过多，可能会导致痱子，从而引起皮肤瘙痒，导致婴儿摇头。痱子通常会出现在婴儿的颈部、腋窝、肘窝等部位。家长可以保持婴儿皮肤清洁干燥，避免出汗过多，同时可以使用痱子粉等产品缓解症状。
4.维生素D缺乏：
维生素D缺乏性佝偻病：维生素D缺乏性佝偻病是由于维生素D摄入不足或吸收不良导致的一种疾病，主要表现为骨骼畸形、多汗、夜惊、摇头等症状。如果家长发现婴儿有上述症状，应及时带其就医，进行相关检查和治疗。
其他：除了维生素D缺乏性佝偻病外，其他一些疾病也可能导致维生素D缺乏，如慢性腹泻、肝胆疾病等。家长应及时带婴儿就医，明确病因，并进行相应的治疗。
5.耳部感染：
中耳炎：中耳炎是婴儿常见的耳部疾病之一，可能会导致耳部疼痛、瘙痒等症状，从而引起婴儿摇头。中耳炎还可能伴有发热、哭闹等表现。家长可以观察婴儿的耳部是否有红肿、分泌物等异常情况，如果怀疑有耳部感染，应及时带其就医，进行相关检查和治疗。
其他：除了中耳炎外，其他一些耳部疾病也可能导致耳部不适，如外耳道炎、耵聍栓塞等。家长应及时带婴儿就医，明确病因，并进行相应的治疗。
总之，如果家长发现五个月大的婴儿在睡觉时经常摇头，应首先排除正常的生理现象和环境因素，如果症状持续不缓解或伴有其他异常表现，应及时带其就医，进行相关检查和治疗。