3个月宝宝睡觉老是摇头，可能是以下原因引起：
1.正常的生理现象：3个月宝宝的前庭功能还未发育完善，会出现摇头的情况，这是正常的生理现象，一般无需特殊处理。
2.湿疹：宝宝头部容易出汗，若家长没有及时清理，会导致宝宝头部瘙痒，从而出现摇头的情况。此外，湿疹还可能伴有皮肤红斑、丘疹等症状。
3.缺钙：宝宝生长发育迅速，若家长没有及时给宝宝补充维生素D，会导致钙吸收不足，从而引起缺钙，出现多汗、摇头、夜惊等症状。
4.耳部疾病：宝宝耳部有耵聍时，会因瘙痒而摇头。此外，中耳炎也会导致宝宝耳部疼痛，从而出现摇头的情况。
5.头皮瘙痒：如果宝宝的头上有皮疹、头垢，或者家长给宝宝使用了不恰当的洗发水，都可能导致宝宝头皮瘙痒，从而出现摇头的情况。
如果宝宝只是偶尔摇头，精神状态良好，家长可以先观察。如果宝宝摇头频繁，伴有睡眠不安、夜惊、多汗等症状，家长应及时带宝宝就医，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。