药流不干净不清宫可能会引发一系列问题。一般来说，药流后宫腔内有残留组织时，若不清宫，首先可能出现阴道流血时间延长，有的女性阴道流血会超过15天，出血量也可能多于月经量。
引发感染风险
宫内残留易滋生细菌： 宫腔内残留的妊娠组织会为细菌提供良好的滋生环境，容易引发子宫内膜炎、盆腔炎等妇科炎症。炎症若上行感染，还可能影响输卵管等部位，进而影响以后的受孕。比如，有研究发现，药流不全不清宫的女性发生盆腔炎的概率比清宫者高出约30%。感染加重的表现： 一旦发生感染，患者可能出现发热、下腹部疼痛、阴道分泌物有异味等症状，严重时还可能导致全身性的感染，危及健康。
影响子宫恢复
子宫收缩受影响： 残留组织在宫腔内会干扰子宫的正常收缩，导致子宫复旧不良。子宫复旧不良会使子宫不能按时恢复到孕前状态，长期如此可能影响子宫的正常功能。例如，正常情况下药流后2 - 3周子宫可基本恢复，而药流不全不清宫的女性，子宫恢复时间可能延长至1个月甚至更久。可能导致子宫粘连： 反复的子宫出血、感染等情况还可能引起宫腔粘连。宫腔粘连会影响月经的正常排出，导致月经量减少，严重的宫腔粘连甚至会造成闭经，还会对今后的怀孕产生阻碍，增加不孕或者宫外孕的发生几率。
持续的身体不适
长期腹痛不适： 残留组织刺激子宫，会让女性持续出现下腹部隐痛或者坠胀感，影响日常生活和工作。这种腹痛可能在劳累、活动后加重，给患者带来长期的身体困扰。心理负担加重： 药流不干净不清宫带来的身体不适和对未来健康的担忧，会使患者产生较大的心理压力，出现焦虑、抑郁等情绪问题，进而影响整体的生活质量。