咽炎扁桃体炎发烧咳嗽可能是细菌、病毒感染等原因引起的，可以通过服用药物、调整生活习惯等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.细菌感染：当身体抵抗力下降时，口腔内的细菌会迅速繁殖，引发感染。此外，过度使用抗生素、免疫抑制剂等也可能导致细菌感染。
2.病毒感染：常见的病毒如鼻病毒、流感病毒、腺病毒等都可能引起咽炎扁桃体炎。这些病毒通过飞沫传播，容易在人群中传播。
3.环境因素：长期处于干燥、多尘、有刺激性气体的环境中，或过度用嗓，都可能导致咽炎扁桃体炎的发生。
4.全身因素：患有某些疾病，如贫血、消化不良、心脏病、肾炎等，也可能导致身体抵抗力下降，容易感染细菌和病毒。
5.其他因素：过敏、反流性食管炎等也可能导致咽炎扁桃体炎的发生。
患者在治疗期间需要注意休息，保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物，可适当食用富含维生素的食物，如蔬菜、水果等。同时，患者需要根据医生的建议，按时服药，避免自行增减药量。