孕三个月肚子隐隐作痛可能是正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现。具体分析如下：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长发育。在这个过程中，子宫可能会出现牵扯性疼痛，表现为肚子隐隐作痛。这种疼痛通常是轻微的，而且不会持续很长时间。
2.激素变化：怀孕后，女性体内的激素水平会发生变化，这也可能导致肚子隐隐作痛。
3.其他原因：如果孕妇在怀孕期间过度劳累、情绪紧张、腹部受到撞击等，也可能会引起肚子隐隐作痛。
需要注意的是，如果肚子隐隐作痛的同时，还伴有阴道出血、破水、发热等症状，或者疼痛逐渐加重，持续时间较长，建议及时就医，以排除先兆流产、宫外孕等异常情况。
在治疗期间，孕妇需要注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。同时，要保持良好的心态，避免紧张和焦虑情绪。饮食上，可以适当食用一些富含蛋白质、维生素和矿物质的食物，如鸡肉、鱼肉、蛋类、蔬菜和水果等，以增强身体的抵抗力。此外，孕妇还需要避免食用辛辣、油腻、刺激性的食物，如辣椒、油炸食品等。