传染性单核细胞增多症的诊断主要通过临床表现、实验室检查等综合判断。一般来说，医生会从多方面入手进行诊断。
临床表现观察
发热情况： 患者通常会出现发热症状，体温可高达39℃左右，发热持续时间不定，可能持续1 - 3周。淋巴结肿大： 全身淋巴结可肿大，以颈部淋巴结肿大较为常见，一般直径可达1 - 3厘米，质地中等，无明显压痛。
实验室检查项目
血常规检查
白细胞计数： 白细胞总数多增高，一般在（10 - 20）×10⁹/L之间，也有部分患者白细胞计数正常或降低。异型淋巴细胞： 外周血中异型淋巴细胞增多，通常超过10%或其绝对值超过1×10⁹/L。
血清学检查
嗜异性凝集试验： 多数患者血清中可出现嗜异性抗体，该试验阳性率可达80% - 90%。一般在发病后1 - 2周出现阳性，4 - 6周达高峰。EB病毒特异性抗体检测： 检测EB病毒壳抗原（VCA）、早期抗原（EA）、核抗原（NA）等特异性抗体。例如，VCA - IgM抗体阳性是近期EB病毒感染的重要标志，多在发病后1周内出现，3 - 4周达高峰，然后逐渐下降。
其他辅助检查
骨髓穿刺检查
骨髓象： 骨髓象一般无特异性改变，但可见淋巴细胞增多，异型淋巴细胞可占10% - 20%，有时可见单核细胞增多。骨髓穿刺主要用于排除其他血液系统疾病等情况。
影像学检查
胸部X线： 部分患者可能出现肺部浸润等表现，有助于了解肺部情况，排除肺部感染等合并症。如果患者出现咳嗽等呼吸道症状，胸部X线检查能辅助判断是否有肺部相关病变。