三个月宝宝感冒喉咙有痰，可能是呼吸道感染、喉软骨发育不良、胃食管反流等原因引起的，可以通过一般治疗、药物治疗等方式缓解，建议及时就医，具体如下：
1.呼吸道感染：
病因：可能是病毒或细菌感染引起的，也可能是支原体、衣原体等感染所致。
治疗：如果是病毒感染，一般不需要使用抗病毒药物，可自行恢复。如果是细菌感染，需要使用抗生素进行治疗。此外，还可使用氨溴索、氨溴特罗等化痰药物，帮助痰液咳出。
注意事项：保持室内空气流通，适当增加空气湿度。宝宝咳嗽时，可轻轻拍打其背部，帮助痰液咳出。多喝水，有助于稀释痰液。
2.喉软骨发育不良：
病因：由于胎儿在母体内喉软骨发育不良，出生后会出现吸气性喉鸣，即喉咙有痰的声音。
治疗：一般不需要特殊治疗，随着宝宝的生长发育，喉软骨会逐渐发育完善，症状会逐渐减轻。
注意事项：注意喂养方式，避免呛奶。
3.胃食管反流：
病因：由于宝宝的胃容量较小，且呈水平位，容易发生胃食管反流，导致喉咙有痰。
治疗：可采取少量多餐的喂养方式，喂奶后及时拍嗝，帮助排出胃内气体。睡觉时可将上半身抬高30度。如果症状严重，可使用奥美拉唑、兰索拉唑等药物进行治疗。
注意事项：避免过度喂养，睡前2~3小时内不要进食。
此外，三个月宝宝感冒喉咙有痰还可能是其他原因引起的，如过敏、先天性气道发育异常等。如果宝宝喉咙有痰的症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。