宝宝发烧39.6°C可能会对脑子造成损害，但这种情况并不是一定会发生的。发烧是身体对抗感染的一种自然反应，当体温升高时，身体的细胞代谢会加快，可能会对大脑的功能产生一定的影响。
一般来说，如果宝宝发烧是由病毒或细菌感染引起的，并且得到了及时的治疗，通常不会对脑子造成长期的损害。但是，如果发烧持续时间较长（超过3-5天），或者体温过高（超过40°C），可能会对大脑造成一定的影响，导致热性惊厥或其他神经系统问题。
因此，如果宝宝发烧39.6°C，家长应该采取以下措施：
1.给宝宝服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚，按照药品说明书的剂量和使用方法进行服用。
2.给宝宝多喝水，以补充因发烧而流失的水分。
3.保持宝宝的环境舒适，穿着宽松透气的衣物，保持室内通风良好。
4.密切观察宝宝的情况，如果宝宝出现精神萎靡、呼吸急促、抽搐等异常情况，应及时就医。
5.如果宝宝发烧持续时间较长或体温较高，或者出现其他异常情况，应及时就医，以便医生进行进一步的诊断和治疗。
总之，宝宝发烧39.6°C可能会对脑子造成损害，但这种情况并不是一定会发生的。家长应该密切观察宝宝的情况，采取适当的措施，如果宝宝出现异常情况，应及时就医。