宝宝发烧39.6°C可能会对大脑造成一定的损害，但这种情况并不是一定会发生的。以下是关于这个问题的具体分析：
发烧本身并不会直接烧坏脑子，但高烧（如39.6°C）可能会对大脑功能产生一定的影响。在高烧的情况下，身体的代谢率增加，细胞能量消耗也增加，如果这种状态持续时间较长或体温过高，可能会导致大脑细胞的损伤。
然而，是否会出现这种情况取决于多个因素，包括宝宝的年龄、整体健康状况、发烧的原因以及治疗的及时性和适当性等。
一般来说，以下情况可能增加大脑受损的风险：
宝宝年龄较小：新生儿和婴儿的大脑发育尚未完全成熟，对高热的耐受性相对较低，因此更容易受到伤害。
潜在的健康问题：如果宝宝有某些潜在的健康问题，如神经系统疾病、心脏病、免疫缺陷等，发烧可能会对大脑功能产生更大的影响。
长时间高烧：持续高烧时间较长（超过几天）或体温过高（超过40°C）可能增加大脑受损的风险。
治疗不及时或不当：如果发烧得不到及时有效的治疗，例如没有使用适当的退烧药或没有采取适当的护理措施，可能会导致体温过高，对大脑产生不利影响。
如果宝宝发烧到39.6°C或更高，以下是一些建议的措施：
及时就医：尽快带宝宝去看医生，进行详细的身体检查和评估，以确定发烧的原因，并根据医生的建议进行治疗。
服用退烧药：按照医生的指示给宝宝服用退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬，以帮助降低体温。
保持适当的护理：确保宝宝摄入足够的水分，保持身体水分平衡。给宝宝穿着适当的衣物，保持舒适的环境温度。
密切观察宝宝的情况：密切观察宝宝的精神状态、呼吸、心跳等情况，如果出现异常症状，如抽搐、意识不清等，应立即就医。
需要注意的是，每个宝宝的情况都是独特的，医生会根据具体情况制定个性化的治疗方案。此外，预防发烧也很重要，保持良好的个人卫生习惯，避免宝宝接触感染源，及时接种疫苗等都有助于减少发烧的发生。
总之，虽然发烧39.6°C可能会对大脑产生一定的影响，但并不是一定会发生的。及时就医、采取适当的治疗措施和密切观察宝宝的情况是非常重要的。如果对宝宝的健康有任何疑虑，最好咨询医生的意见。同时，也要关注宝宝的整体健康和预防措施，以保障宝宝的健康成长。